François Charon (1654-1719) était un marchand qui a beaucoup donné à sa communauté et aux pauvres. Il a fondé les Frères Hospitaliers de la Croix et de Saint-Joseph et surtout l’Hôpital Général de Montréal. C’est le nom de ce grand bienfaiteur de la santé qui a amené le nom du centre Francois Charon.

D’abord conçu pour la rééducation des accidentés de la CSST en 1964, le centre est devenu le centre hospitalier de réadaptation pour l’est du Québec en 1974.

En mai 1995 on a l’a incorporé à l’Institut de réadaptation physique de Québec (IRDPQ) avec un statut universitaire.